Die MedUni plant daher die Beschaffung eines hochpräzisen long-read-Sequenziergerätes das SNVs, Indels, SV, TR und DNA-Methylierungen mit möglichst langen Fragmenten in bestmöglicher Qualität genomweit sequenzieren kann und zusätzlich auch Phasing- und Volllängen-RNA-Analysen ermöglicht. Im Hinblick auf die geplante Forschung bzw die Forschungsausrichtung des Zentrums wird ein Mindestdurchsatz von 1000 humanen Genomen mit 30-facher Abdeckung pro Jahr benötigt. Hierzu wird ein Verhandlungsverfahren ohne vorherige Bekanntmachung mit einem Unternehmen gemäß § 36 Abs 1 Ziffer 3 BVergG 2018 durch.
Das Zentrum für Pathobiochemie und Genetik, benötigt ein Long-Read-Sequenziergerät, dass in der Lage ist durchschnittliche native Sequenzlänge von ca.15‘000bp zu erreichen und sind die hierfür maßgeblichen Gründe nachstehend angeführt. Ein Abgehen von diesen Anforderungen würde die Forschungsqualität maßgeblich negativ beeinträchtigen. Die Auftraggeberin hat im Vorfeld der Verfahrensführung eine europaweite bekanntgemachte und über die Beschaffungsplattform der Auftraggeberin abgewickelte Markterkundung durchgeführt, veröffentlicht am 19.3.2024 im Amtsblatt der Europäischen Union unter der Veröffentlichungsnummer: 165014-2024, Nummer der Ausgabe des Amtsblattes: 56/2024). Die Analyse der abgegebenen Unterlagen durch sachverständige Forscher:innen hab dabei ergeben, dass nur das von von Pacific Biosciences of California, Inc. angebotene Gerät (“Revio”) alle Mindestanforderungen erfüllt und insb eine durchschnittliche native Sequenzlänge von ca.15‘000bp bietet. Sonstige angebotene Geräte erfüllen hingegen die Mindestanforderungen nicht, weil aufgrund der verwendeten Technik im Wesentlichen eine rechnerische Zusammensetzung von short-reads (150bp) erfolgt welche nur eine Länge von ca. 6000bp besitzen. Das künstliche zusammensetzten der short-reads ist auch sehr rechenintensiv und kann deshalb nicht Vorort durchgeführt werden. Für die Berechnung müssen alle Patientensequenzen (bis zu 800GB pro Patient) über das Internet ins Ausland transferiert werden und wäre die Analyse somit gänzlich von für die Auftraggeberin nicht steuerbaren Variablen (insbesondere Qualität und Übertragungsrate der Internetverbindung, Fehlübertragungen, Datenverlust etc) abhängig, was im gegenständlichen Forschungsbereich und im Hinblick auf die Art der verwendeten Daten nicht rechtfertigbar ist und ein enormes Sicherheitsrisiko für den Schutz der Patientendaten darstellen würde, was nur durch einen enormen und unzumutbaren administrativen sowie technischen Mehraufwand gegebenenfalls eingeschränkt verhindert werden könnte. Ebenso ist mit sonstigen Geräten das gleichzeitige analysieren der Nukleotidsequenz und des Methylierungsstatus nicht möglich. Im Übrigen wird auch keine Volllängen-RNA-Analyse angeboten.Die Vergabe erfolgt frühestens nach Ablauf von 10Tagen gerechnet von Zeitpunkt der ex-Ante Transparenzbekanntmachung.